پژوهشکدۀ مهرستان (مطالعات حکمرانی)، یک پژوهشکدۀ تقاضامحور و خودگردان است که با همکاری مشترک دانشگاه اصفهان و مرکز احیاء اندیشه و سیرۀ علوی راه‌اندازی شده است و به منظور تلاش فعال و اثربخش در حوزۀ حکمرانی نظام اسلامی و با اولویت مسائل حوزۀ خانواده، تعلیم و تربیت، رسانه و مدیریت از طریق طراحی، تدوین، پیاده‌سازی و نشر مدل‌های کاربردی مبتنی بر معارف قرآن و سیرۀ اهل‌بیت(علیهم‌السلام)، فعالیت می‌نماید. در حال حاضر، چهار اندیشکده ذیل پژوهشکدۀ مهرستان مشغول به فعالیت هستند: